С автобусами непонятно, я так поняло что это в тех где установили банковские терминалы уже. В Питере таких точно не много.
Знаю еще что ВРОДЕ КАК собирались установить валидаторы Подорожника для записи в некоторых Пятерочках, но хз сделали ли. Еще можно пополнять ( записью ресурса!) в некоторых банкомата Сбера, но, сцуко, работает только при пополнении с карты Сбера, просто записать левое пополнение нельзя, да и список банкоматов надо искать на сайте Сбера.
А так-то да, в Спб все это адово привязано к инфраструктуре метро, что есть отстой.
В Московии вон я знаю Тройку можно чуть ли не где угодно пополнить.

Кстати если ты стоишь в Метро, надо срочно пополнить Подорожник (картой), а то ли тумбы не работают, то ли там толпа и очередь то еще есть лайфхак - банкоматы банка Санкт-Петербург - там отож можно пополнить по номеру подорожника и тут же пойти записать на валидаторе в фойе.
А еще можно тупо пройти в метро по пейпасу, но это невыгодно и не всегда срабатывает - был случай, бабос списали, а двери не открылись.

Автобусы пишут с 14-ого числа только заработает - http://www.transportspb.com...ozhnika-v-avtobusax/